工程咨询服务的征税方式主要根据服务提供方的性质（一般纳税人或小规模纳税人）以及服务类型来决定。以下是具体的征税情况：
营业税
一般纳税人：工程咨询服务费一般纳税人税率为6%，且可以抵扣进项税额。
小规模纳税人：工程咨询服务费小规模纳税人征收率为3%。
综合税率：营业税及其附加（城市维护建设税、教育费附加和地方教育费）的综合税率大约为5.5%或5.6%。
增值税
一般纳税人：提供现代服务业服务（除有形动产租赁服务外），增值税税率为6%。
小规模纳税人：提供现代服务业服务，增值税征收率为3%。
建议
一般纳税人：如果您的工程咨询服务符合增值税一般纳税人的条件，建议选择6%的增值税税率，以便享受进项税额抵扣的优惠。
小规模纳税人：若您的企业规模较小，选择3%的增值税征收率可能更为合适，因为这是目前针对小规模纳税人的较低税率。
请根据您的企业性质和服务内容，选择最适合的税率和税种进行申报和缴纳税款。
