饮用水消毒的目的是杀灭水中对人体健康有害的绝大部分病原微生物，其中包括细菌、病毒、原生动物等，以防止通过饮用水传染疾病。由于消毒外理并不能完全杀灭水中所有微生物，所以消毒处理是在达到饮用水水质微生物学标准的条件下，将饮用水导致的水介传染病的风险降到最低，达到完全可以接受的水平。
饮用水消毒方法有以下几种:
1.物理消毒
水的物理消毒可用加热、过滤、紫外线、辐射消毒等方法。煮沸常用，简便易行，效果可靠，适于少量水处理。过滤的方法简单有效，但只是除菌而不是杀菌，常用的有砂滤、石棉滤板、纤维酯滤膜等。
2.化学消毒
指用化学消毒剂进行水的消毒。国内、外常用的饮用水消毒剂仍以卤素为主，尤其是氯消毒剂。
含氯制剂:含氯饮水消毒剂种类较多，如漂白粉、次氯酸钙、氯胺、二氯异氰尿酸钠等。由于水源水质不同，加氯量应根据需氯量试验来确定，经过混凝、沉淀、过滤的水或清洁的地下水，加氯量0.5~1.5毫克/升。水质较差则加1.0~2.5毫克/升(或1~4毫克/升)。
3.臭氧(活氧)消毒
臭氧(活氧)是一种强氧化剂，具有广谱高效杀菌作用。对饮用水消毒时，将溶有臭氧(活氧)的吸收液与水充分混合即可。其中海众电解水的臭氧(活氧)发生器，结构简单，体积小且重量轻，无噪声，产物中无有害的氯化物。
