在离婚案件中，有两个孩子的抚养权判决主要依据《中华人民共和国民法典》的相关规定。以下是具体的判决原则和处理方式：
两周岁以下的子女
原则上随母亲生活，除非母亲存在严重疾病、传染病或其他不适合抚养孩子的情况。
两周岁到八周岁之间的子女
法院会综合考虑双方的经济能力、生活环境、教育背景、与孩子的感情联系等因素，以判断哪一方更有利于孩子的成长。
八周岁以上的子女
法院会尊重孩子的真实意愿，如果孩子明确表示愿意跟随某一方生活，法院通常会满足孩子的选择。
双方协商一致
如果夫妻双方能够就孩子抚养问题协商一致，可以按照双方的约定进行处理，例如一方抚养一个孩子，另一方支付抚养费等。
具体案例说明
假设有一对夫妻离婚，他们有两个孩子，一个五岁，一个十岁。双方都不能就抚养问题达成一致。
五岁的孩子：由于五岁的孩子已经有一定的自理能力，但尚需稳定的成长环境，法院可能会考虑哪一方的经济条件更好，能提供更好的物质生活和教育环境。如果爸爸的经济条件更好，可能会判决爸爸抚养五岁的孩子。
十岁的孩子：由于十岁的孩子已经接近成年，法院会更多地尊重孩子的真实意愿。如果孩子明确表示愿意跟妈妈生活，法院可能会判决妈妈抚养十岁的孩子。
建议
提前规划：父母在离婚前应尽量协商好孩子的抚养权问题，以减少对孩子的伤害。
提供证据：在法庭上，双方应提供充分的证据来证明自己的抚养能力和条件，以便法院作出公正的判决。
关注孩子意愿：对于年龄较大的孩子，法院会尊重其意愿，因此父母应提前与孩子沟通，了解其真实想法。
通过以上原则和具体情况分析，法院会在保障孩子健康成长的前提下，作出合理的抚养权判决。
